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大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為，病因?qū)W對(duì)預(yù)后的意義有限，認(rèn)為病因明確或不明確與預(yù)后之間無明顯關(guān)系。
　 （1）腦腫瘤 由腦腫瘤引起的癲癇，其預(yù)后取決于腫瘤的性質(zhì)、部位、大小及能否根治等因素；另一方面，即使腫瘤被根除，但由于手術(shù)遺留的疤痕仍可成為致癇灶。近幾年隨著腫瘤外科治療水平的提高，其預(yù)后也有明顯的改善。有學(xué)者隨訪了115例腦瘤合并癲癇并經(jīng)手術(shù)治療的病人，癲癇發(fā)作完全控制者占31%；26%的病人只是在術(shù)后第1年內(nèi)曾有幾次癲癇發(fā)作，以后很少發(fā)作，同時(shí)有腫瘤復(fù)發(fā)；16%的病人癲癇發(fā)作無改善。還有人報(bào)道，腦膜瘤伴發(fā)癲癇的病人，手術(shù)后癲癇發(fā)作完全控制者占50%，25%的病人發(fā)作明顯減輕，其余25%的病人癲癇發(fā)作未改善，由轉(zhuǎn)移性腦腫瘤引起的癲癇，其預(yù)后肯定不良。
　 （2）腦血管病 老年性癲癇患者，其主要病因?yàn)槟X血管病（如腦動(dòng)脈硬化、腦出血、腦梗死等），少數(shù)腦瘤或腦轉(zhuǎn)移瘤所致。有關(guān)腦血管病引起的癲癇的預(yù)后問題，長(zhǎng)期隨訪報(bào)道較少。有人認(rèn)為腦血管病引起癲癇發(fā)病率較低，預(yù)后較差，約60%的患者可以完全緩解，且復(fù)發(fā)率較低。但是有人報(bào)道，腦血管病，特別是天幕上腦梗死的急性期限生癲癇者預(yù)后不良，癲癇復(fù)發(fā)率高達(dá)60%。腦梗死急性期有癲癇發(fā)作者，其死亡率為30%。
　 （3）外傷性癲癇 有關(guān)外傷性癲癇的緩解率，各家報(bào)道不一致。其預(yù)后尚決定于外傷的部位、性質(zhì)、昏迷持續(xù)時(shí)間、腦損傷的程度有無顱內(nèi)感染等因素。在較輕的頭部外傷后數(shù)分鐘內(nèi)出現(xiàn)的癲癇通常只發(fā)作一次，以后不再發(fā)作，這種癲癇發(fā)作預(yù)后最佳。外傷后只發(fā)作幾次的病人，預(yù)后良好。
　 （4）腦炎 腦炎的急性期常伴有不同程度的癲癇發(fā)作，部分腦炎病人痊愈后也可出現(xiàn)癲癇發(fā)作。一般病人服用抗癲癇藥物均可控制發(fā)作，預(yù)后比較好。有人報(bào)道，腦炎和腦膜炎伴發(fā)癲癇的患者，腦炎或腦膜炎痊愈后53.3%的病人癲癇發(fā)作可完全緩解，但嚴(yán)重腦炎后遺癥伴有頻繁癲癇發(fā)作者預(yù)后不理想。
　 （5）腦囊蟲病 腦囊蟲病是成人癲癇的常見原因之一，50%-70%的腦囊病人有癲癇發(fā)作。國(guó)外有學(xué)者在1992年對(duì)153例病人進(jìn)行6個(gè)月至5年（平均28±6個(gè)月）的隨訪，發(fā)現(xiàn)31例非活動(dòng)期病變者，單獨(dú)使用抗癲癇的藥物便可以使癲癇發(fā)作得以控制。122例活動(dòng)期病變者中95例同時(shí)給予抗囊蟲藥治療，79例癲癇發(fā)作得到控制，未給予抗囊蟲治療的27例中，僅7例癲癇發(fā)作得到控制，即單獨(dú)使用抗癲癇藥物治療的患者，只有26%的病人的癲癇發(fā)作得到控制，同時(shí)給予抗囊蟲治療的病人，83%的癲癇發(fā)作得到滿意的控制，因此，由腦囊蟲病引起的癲癇，其預(yù)后關(guān)鍵在于抗囊蟲治療。
　 （6）其他病變 由于分娩時(shí)或出生后因素致病者，即伴有器質(zhì)性腦損傷，如腦出血、先天性腦發(fā)育不全、大腦性癱瘓及精神缺陷等，其預(yù)后不良。某些先天性疾病，如結(jié)節(jié)性硬化癥、腦三叉血管瘤病、神經(jīng)纖維瘤病等，預(yù)后也差。
顱外病因引起的癲癇，其預(yù)后與原發(fā)病有關(guān)。如酒精中毒并發(fā)癲癇，若中毒狀態(tài)和癲癇均得到充分治療，其預(yù)后良好；胰島細(xì)胞腺瘤被有效地切除，低血糖狀態(tài)被糾正，其預(yù)后也好；作為慢性腎病中尿毒癥的并發(fā)癥，相應(yīng)的預(yù)后不良。